新技術企業優先享受國家、省、北京高新企業證書的代理公司市有關的科研經費支持和財政撥款。如南京市：進入市高新技術企業培育庫的企業給予最高20萬元獎勵，進入省高新技術企業培育庫的企業再按省支持標準給予1:1共同支持，北京高新企業證書的代理公司首次通過高新技術企業認定的給予50萬元獎勵。高新技術企業可申請國家和地方重大科技支撐項目和設備、基金、貸款、貼息和投資，貸款額度最高3000萬元，貸款利率最低可至基準利率。
3、政府招標加分
政府部門的招投標，優先考慮高新技術企業，行業內的招投標，北京高新企業證書的代理公司可將高新技術企業設為加分項。如蘇代理中區發布的公告中，投標單位是高新技術企業的，最高可加3分。
4、優先批地、房租水電減免
如合肥市，租賃合肥經濟技術開發區內場地的國家級高新技術企業，代理在高企有效期內，代理年繳納稅收達到200元/平方米/年，年納稅額增長率比上年度增加不低于15%，按照20元/平方米/月（不超過企業租賃價格）給予房租補助，補助面積不超過800平方米。
5、其他優勢
研發費用加計按70%扣除；土地出讓金按50-75%征收；研發費或無形資產按150%扣除或攤銷；企業技術轉讓所得可免征或減半征收所得稅；技術性轉讓、開發、咨詢、服務取得的收入免征營業稅；縮短折舊年限或加速折舊；代理落戶加分；代理提升企業品牌形象，代理領先于同行更好地開發國內外市場等。
國家重點支持的高新技術八大領域
一、電子信息
二、生物與新醫藥
三、航空航天
四、新材料
五、高技術服務
六、新能源與節能
七、資源與環境
八、先進制造與自動化
高新技術企業認定條件
（一）企業申請認定時須注冊成立一年以上；
（二）企業通過自主研發、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產品（服務）在技術上發揮核心支持作用的知識產權的所有權；
（三）對企業主要產品（服務）發揮核心支持作用的技術屬于《國家重點支持的高新技術領域》規定的范圍；
（四）企業從事研發和相關技術創新活動的科技人員占企業當年代理職工總數的比例不低于10%；
（五）企業近三個會計年度（實際經營期不滿三年的按實際經營時間計算，下同）的研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例符合如下要求：
1、最近一年銷售收入小于5,000萬元（含）的企業，比例不低于5%；
2、最近一年銷售收入在5,000萬元至2億元（含）代理的企業，比例不低于4%；
3、最近一年銷售收入在2億元以上的企業，比例不低于3%。
其中，企業在中國境內發生的研究開發費用總額占全部研究開發費用總額的比例不低于60%；
（六）近一年高新技術產品（服務）收入占企代辦業同期總收入的比例不低于60%；
（七）企業創新能力評價應達到相應要求；
（八）企業申請認定前一年內未發生重大安全、代辦重大質量事故或嚴重環境違法行為。
高新技術企業認定程序如下
（一）企業申請
企業做自我評價，符合認定條件的在“代理高新技術企業認定管理工作網”注冊登記，向認定機構提出認定申請。申請時提交下列材料：
1、高新技術企業認定申請書；
2、證明企業依法成立的相關注冊登記證件；
3、知識產權相關材料、科研項目立項證明、代辦科技成果轉化、研究開發的組織管理等相關材料；
4、企業高新技術產品（服務）的關鍵代理技術和技術指標、生產批文、認證認可和相關資質證書、產品質量檢驗報告等相關材料；
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